崗位職責(zé):
1、獨立負責(zé)臨床微生物多組學(xué)數(shù)據(jù)分析項目,涵蓋微生物基因組、微生物轉(zhuǎn)錄組/宏轉(zhuǎn)錄組、蛋白組學(xué)、16S/ITS擴增子測序、宏基因組學(xué);
2、為客戶提供專業(yè)的售后技術(shù)支持,包括結(jié)果解讀、個性化分析、問題排查與解決方案建議。
3、使用Snakemake等流程管理工具,構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)化、可重復(fù)的分析管道;維護和優(yōu)化現(xiàn)有微生物組學(xué)分析流程,提升計算效率和結(jié)果可靠性;建立臨床微生物數(shù)據(jù)分析的質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)和最佳實踐指南。
4、深入挖掘微生物多組學(xué)數(shù)據(jù)與臨床表型以及流行病學(xué)特征的關(guān)聯(lián);開發(fā)適用于臨床樣本的生物信息分析方法,處理低生物量、高宿主污染等挑戰(zhàn);
任職要求:
1、碩士及以上學(xué)歷,生物信息學(xué)、流行病學(xué)、微生物基因組學(xué)或相關(guān)交叉學(xué)科;
2、1年以上微生物相關(guān)組學(xué)數(shù)據(jù)分析以及流程開發(fā)經(jīng)驗,具備分子流行病學(xué)項目經(jīng)驗(如病原體溯源、暴發(fā)調(diào)查、耐藥性監(jiān)測等)優(yōu)先。
3、熟悉高通量測序數(shù)據(jù)分析流程,具備基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組等常見組學(xué)數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗;熟悉病原體分子分型數(shù)據(jù)庫與工具、細菌基因組組裝、注釋、比較基因組學(xué)以及統(tǒng)計建模。
4、熟練掌握至少一門編程語言(如Python/R/Shell),具備腳本編寫和流程開發(fā)能力。
5、熟悉Linux操作系統(tǒng)及集群環(huán)境,掌握常用生物信息學(xué)工具與數(shù)據(jù)庫。
6、以第一作者在相關(guān)領(lǐng)域發(fā)表過學(xué)術(shù)論文。