2005年7月，蒲公英中學(xué)籌備處開始試運(yùn)營。學(xué)校于2006年1月獲得教育系統(tǒng)的辦學(xué)許可證，并且在民政系統(tǒng)正式注冊為民辦非營利組織，成為北京市第一所，也是唯一一所服務(wù)于流動兒童義務(wù)教育的公益性、非營利性學(xué)校。2017年，民政系統(tǒng)評定學(xué)校為AAAAA級公益組織。

蒲公英中學(xué)學(xué)校實(shí)行理事會指導(dǎo)下的校長負(fù)責(zé)制。理事會成員由事業(yè)有成，熱衷于回饋社會、關(guān)注教育的志愿者組成。學(xué)校內(nèi)部日常事務(wù)由黨支部、議事會和學(xué)術(shù)委員會負(fù)責(zé)管理。常務(wù)理事會和工會對與教職員工相關(guān)的重大問題進(jìn)行討論和決策。財(cái)務(wù)管理上，學(xué)校秉持高度專業(yè)、高度透明的原則，最大效益地使用學(xué)校的公共財(cái)產(chǎn)。每年發(fā)布《蒲公英中學(xué)年報(bào)》，公布業(yè)務(wù)活動和年檢信息。平時捐物捐款信息每周更新，在學(xué)校網(wǎng)站披露。

使命：教育公平與優(yōu)質(zhì)教育合一。

校訓(xùn)：自信、樂群、求真、創(chuàng)造。

理念：

- 人民教育家陶行知先生的“愛滿天下”之精神是蒲公英中學(xué)師生安身立命之本。

-“千教萬教教人求真，千學(xué)萬學(xué)學(xué)做真人” 的真諦是辦學(xué)的宗旨。

- 相信教育改變命運(yùn)，親手創(chuàng)造公平機(jī)會。

- 思想與行動古為今用，洋為中用，尋找真知灼見，致知在格物。

- 事無巨細(xì)，呵護(hù)師生的尊嚴(yán)與個性。

- 在教書中育人，在育人中改變世界；遠(yuǎn)處著眼，近處著手。

- 一個都不能少。

- 學(xué)校成功的唯一標(biāo)志是學(xué)生身心健康地成長，成為正人君子，并有能力回饋社會。學(xué)校也成為教職員工實(shí)現(xiàn)人生價(jià)值的寬廣平臺。

蒲公英中學(xué)是一所承擔(dān)義務(wù)教育的民辦學(xué)校，提供初中階段的課程，其中語文、歷史和思想品德使用教育部統(tǒng)編教材，其它科目采用人民教育出版社的教材。學(xué)校對全套教育部規(guī)劃的課程開全開足，并且開發(fā)了針對學(xué)生需求的特色校本課程。在學(xué)校完成了初中三年級課程的學(xué)生，參加北京市統(tǒng)一進(jìn)行的高中入學(xué)考試。此外，每學(xué)期學(xué)生通過參加至少一個興趣小組的活動，品驗(yàn)興趣，發(fā)展?jié)撃?，提高修養(yǎng)。

來蒲公英中學(xué)就讀的學(xué)生及其家長，就加入了蒲公英社區(qū)。這是一個非常獨(dú)特的社區(qū)，學(xué)校的誕生和發(fā)展都得力于蒲公英社區(qū)的六位一體，大家目標(biāo)求同，缺一不可，與孩子們共同成長。學(xué)校設(shè)立家長委員會，參與學(xué)校對教育的討論和改進(jìn)。

學(xué)校座落在北京市大興區(qū)西紅門鎮(zhèn)老三余村，位于南四環(huán)與南五環(huán)之間，南中軸線西側(cè)。簡樸實(shí)用的校區(qū)占地十六畝，建筑面積16,570平方米。寬敞明亮的通用教室、裝備齊全的物理、化學(xué)、生物實(shí)驗(yàn)室、史地實(shí)驗(yàn)室、電腦工作室、書法工作室、美術(shù)工作室、新能源學(xué)習(xí)室、圖書館、教研中心、風(fēng)雨操場、樂舞中心、中華非遺工坊、食育廚房等一應(yīng)俱全，還有辦公室、近一百間宿舍，食堂、心理健康咨詢室、屋頂花園、操場等配套設(shè)施。這里為學(xué)生的寄宿學(xué)習(xí)生活創(chuàng)造了必要而充足的條件。由志愿團(tuán)隊(duì)義務(wù)承擔(dān)的校園設(shè)計(jì)是社會大愛的匯聚。每一個功能房間或區(qū)域都以捐贈者選擇的名字命名，每一個命名背后都是一個催人成長的真實(shí)故事。孩子們踏進(jìn)校園的第一步，心靈就已經(jīng)在這獨(dú)一無二的學(xué)習(xí)環(huán)境中開始接受溫潤的滋養(yǎng)。